O sistema Kliniki dispõe de uma nova forma de arquivar pedidos médicos, guias e quaisquer outros documentos, dentro da matrícula de cada paciente. Sendo necessário somente a instalação de um Scanner na unidade.
O escaneamento é feito à partir do Kliniki por uma tecla de função, e os arquivos são armazenados na forma compactada, não utilizando muito espaço em disco.